Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN8P19075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms