Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB2P17787 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB2P17787 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms