Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB9P17482 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB9P17482 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB9P17482 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms