Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSPP15924 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSPP15924 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSPP15924 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DSPP15924 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DSPP15924 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSPP15924 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSPP15924 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DSPP15924 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DSPP15924 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DSPP15924 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSPP15924 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSPP15924 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSPP15924 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSPP15924 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSPP15924 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSPP15924 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSPP15924 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSPP15924 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSPP15924 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DSPP15924 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSPP15924 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSPP15924 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSPP15924 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSPP15924 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSPP15924 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms