Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAG1P15918 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAG1P15918 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAG1P15918 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG1P15918 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAG1P15918 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAG1P15918 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG1P15918 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG1P15918 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAG1P15918 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAG1P15918 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG1P15918 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms