Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VEGFAP15692 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VEGFAP15692 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFAP15692 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VEGFAP15692 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms