Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4HA1P13674 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms