Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms