Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL11A1P12107 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL11A1P12107 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms