Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VPREB1P12018 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms