Protein–RNA interactions for Protein: P10721

KIT, Mast/stem cell growth factor receptor Kit, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KITP10721 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KITP10721 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KITP10721 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KITP10721 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KITP10721 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KITP10721 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KITP10721 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KITP10721 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KITP10721 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KITP10721 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KITP10721 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KITP10721 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KITP10721 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KITP10721 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KITP10721 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KITP10721 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KITP10721 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KITP10721 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KITP10721 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms