Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI2P10070 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI2P10070 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI2P10070 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI2P10070 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI2P10070 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI2P10070 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI2P10070 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI2P10070 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI2P10070 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI2P10070 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI2P10070 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI2P10070 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLI2P10070 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLI2P10070 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLI2P10070 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLI2P10070 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLI2P10070 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLI2P10070 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI2P10070 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI2P10070 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI2P10070 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI2P10070 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI2P10070 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GLI2P10070 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GLI2P10070 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GLI2P10070 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI2P10070 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLI2P10070 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
GLI2P10070 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
GLI2P10070 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GLI2P10070 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GLI2P10070 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
GLI2P10070 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLI2P10070 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLI2P10070 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLI2P10070 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI2P10070 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GLI2P10070 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GLI2P10070 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GLI2P10070 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GLI2P10070 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GLI2P10070 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GLI2P10070 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
GLI2P10070 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GLI2P10070 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GLI2P10070 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLI2P10070 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLI2P10070 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLI2P10070 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLI2P10070 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GLI2P10070 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms