Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP9P0CG40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP9P0CG40 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms