Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRR29P0C7W0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR29P0C7W0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR29P0C7W0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms