Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS17P08708 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS17P08708 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS17P08708 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS17P08708 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS17P08708 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS17P08708 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS17P08708 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS17P08708 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS17P08708 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS17P08708 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS17P08708 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS17P08708 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS17P08708 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS17P08708 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS17P08708 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS17P08708 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS17P08708 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS17P08708 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS17P08708 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS17P08708 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392.2 ms