Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI1P08151 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI1P08151 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI1P08151 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI1P08151 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI1P08151 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI1P08151 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI1P08151 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI1P08151 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI1P08151 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI1P08151 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI1P08151 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI1P08151 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI1P08151 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI1P08151 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI1P08151 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI1P08151 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI1P08151 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI1P08151 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI1P08151 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI1P08151 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI1P08151 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI1P08151 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI1P08151 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI1P08151 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI1P08151 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI1P08151 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI1P08151 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI1P08151 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI1P08151 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI1P08151 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms