Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CSF1RP07333 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSF1RP07333 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms