Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTMAP06454 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTMAP06454 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTMAP06454 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTMAP06454 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTMAP06454 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTMAP06454 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTMAP06454 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTMAP06454 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTMAP06454 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTMAP06454 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTMAP06454 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTMAP06454 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTMAP06454 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTMAP06454 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTMAP06454 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms