Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC3P02656 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC3P02656 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC3P02656 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC3P02656 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC3P02656 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC3P02656 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC3P02656 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC3P02656 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC3P02656 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC3P02656 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC3P02656 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC3P02656 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC3P02656 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC3P02656 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC3P02656 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC3P02656 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC3P02656 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms