Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOA1P02647 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOA1P02647 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA1P02647 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA1P02647 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA1P02647 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA1P02647 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA1P02647 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA1P02647 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA1P02647 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA1P02647 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA1P02647 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA1P02647 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms