Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIMP1P01033 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms