Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDHAP00338 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDHAP00338 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDHAP00338 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDHAP00338 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDHAP00338 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDHAP00338 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDHAP00338 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDHAP00338 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDHAP00338 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDHAP00338 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDHAP00338 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDHAP00338 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDHAP00338 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHAP00338 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHAP00338 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHAP00338 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHAP00338 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHAP00338 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHAP00338 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHAP00338 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LDHAP00338 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LDHAP00338 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHAP00338 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms