Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms