Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX6O95503 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX6O95503 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX6O95503 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX6O95503 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX6O95503 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX6O95503 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX6O95503 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX6O95503 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms