Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOBTB3O94955 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms