Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN2O75298 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN2O75298 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN2O75298 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN2O75298 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN2O75298 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN2O75298 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN2O75298 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN2O75298 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN2O75298 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN2O75298 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN2O75298 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN2O75298 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN2O75298 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN2O75298 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN2O75298 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN2O75298 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN2O75298 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN2O75298 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN2O75298 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN2O75298 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN2O75298 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN2O75298 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN2O75298 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN2O75298 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN2O75298 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN2O75298 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN2O75298 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN2O75298 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN2O75298 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN2O75298 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN2O75298 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN2O75298 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN2O75298 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN2O75298 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms