Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms