Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK2O60296 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms