Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS11DO60235 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms