Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT86O43790 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT86O43790 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT86O43790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT86O43790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT86O43790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms