Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN6O43657 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms