Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGOLN2O43493 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGOLN2O43493 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms