Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms