Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms