Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MID1O15344 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MID1O15344 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MID1O15344 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID1O15344 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID1O15344 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID1O15344 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MID1O15344 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID1O15344 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID1O15344 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID1O15344 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID1O15344 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID1O15344 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID1O15344 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID1O15344 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1O15344 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1O15344 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1O15344 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms