Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPEF2O14830 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms