Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VCYO14598 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VCYO14598 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VCYO14598 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VCYO14598 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VCYO14598 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCYO14598 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCYO14598 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCYO14598 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCYO14598 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCYO14598 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCYO14598 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms