Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN6O00399 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN6O00399 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms