Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B1O00203 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms