Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP23O00161 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP23O00161 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms