Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
I3L3M4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
I3L3M4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
I3L3M4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
I3L3M4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
I3L3M4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
I3L3M4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
I3L3M4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
I3L3M4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
I3L3M4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
I3L3M4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
I3L3M4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
I3L3M4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
I3L3M4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
I3L3M4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
I3L3M4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms