Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BRM9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BRM9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BRM9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BRM9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BRM9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BRM9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BRM9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BRM9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BRM9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3BRM9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BRM9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms