Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BQV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BQV1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQV1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQV1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQV1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQV1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQV1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms