Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms