Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHLA1C9JL84 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHLA1C9JL84 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms