Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM49D1C9J1S8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49D1C9J1S8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM49D1C9J1S8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms