Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1CA8MV81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1CA8MV81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms