Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PP2D1A8MPX8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PP2D1A8MPX8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms