Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC69A6NI79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms