Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01546A6NGU7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms